3000 jaar voor christus waren het de lelegianen en de carianen die van anatolie richting de pilavberg in Kusadasi kwamen,zij waren de grondleggers van de steden ania en melia.Door het zachte klimaat hadden ze de mogelijkheid om essentieele producten zoals olijven,druiven en vijgen te produceren om olie,wijn en snoep van te maken.

Tijdens de 10e eeuw voor christus werden er 12 steden Gebouwd, Samos, Khios, Miletos, Priene, Ephesus, Teos, Erythrai, Priena, Klazonemi, Lebedos, Phokaia, Colophon en Smyrna, gereputeerd als de meest ontwikkelde steden van die periode. Panonian,phygale,marathesion en neopolis waren steden die ook rond Kusadasi ontstonden tijdens deze periode. Miletos en Ephesus waren de meest populaire steden daar zij de belangrijkste havens hadden.

De stad werd ingenomen door de perzen rond 546 jaar voor christus.200 jaar voor christus werd Kusadasi en omgeving ingenomen door het romeinse rijk en werd het een byzantijnse staat. Door de grote klimaatsveranderingen in die periode werd ephesus bijna volledig vernietigd door aardbevingen en verloor daarmee zijn aanzien als belangrijkste havenstad.de byzantijnen werden daarmee verplicht om een nieuwe haven te gaan zoeken rond neopolis en 'scala nova' was de naam van deze nieuwe haven.Bij het naderen van de 15e eeuw was scala nova ingenomen door de venetiaanse scheepvaartlui en handelaars.

De turkse invasie ging in onder leiding van Seljukian Kilic Arslan de 2e, de ideale ligging van Kusadasi via de zijderoute had een grote invloed op de groei van de stad als zakenstad.

In 1413 werd Kusadasi door het ottomaanse rijk geleid na de invasie van sultan mehmet celebi. De ottomanen waren de grondleggers van de mooie architecturale gebouwen en huizen die nu nog steeds te bezichtigen zijn in en rond Kusadasi.okuz mehmet pasa caravanserai was de grondlegger en architect van de meeste forten,stadsmuren en moskees in het centrum van de stad tijdens het bewind van Sultan Ahmet 1 en Osman 2.

Na de eerste wereldoorlog werd Kusadasi in 1919 ingenomen door de grieken,na jarenlange gevechten werd Kusadasi terug een deel van de turkse republiek in 1922.Izmir was de hoofdstad van Kusadasi tot 1954.Daarna werd de hoofstad aydin en is het tot op heden nog altijd een bloeiende haven en zakenstad.